Постановлением управления федеральной антимонопольной службы по Забайкальскому краю от 23-го октября 2008 года он был признан виновным в совершении административного правонарушения, предусмотренного кодексом об административных правонарушениях России – «Несоблюдение требований законодательства о размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг» и наказан административным штрафом на сумму 30 тысяч рублей.
При этом Андрей Шемелин, не желая уплачивать штраф из собственных средств, дал устное распоряжение начальнику финансово-экономического отдела администрации городского поселения «Чернышевское» Ануфриевой произвести его уплату из средств бюджета городского поселения «Чернышевское». 12-го ноября 2008 года чиновница произвела в ОАО «Читапромстройбанк» уплату штрафа, а также оплатила услуги банка в размере 450-ти рублей. Незаконными действиями Андрея Шемелина городскому поселению «Чернышевское» был причинён имущественный ущерб на сумму 30 450 рублей.
По выявленным нарушениям закона прокурором района в адрес исполняющего обязанности главы администрации городского поселения «Чернышевское» внесено представление с требованием устранить причины подобных нарушений. Кроме этого, прокурор района направил в мировой суд исковое заявление о взыскании с Шемелина в бюджет городского поселения 30 450 рублей.
Также прокурор района четвёртого октября 2011 года направил в следственный орган постановление и материалы проверки для решения вопроса об уголовном преследовании в отношении бывшего главы администрации ГП «Чернышевское» Андрея Шемелина по признакам состава преступления, предусмотренного частью третьей статьи 160 уголовного кодекса России – «Присвоение или растрата, совершённые лицом с использованием своего служебного положения», сообщает пресс-служба прокуратуры Забайкальского края.