На протяжении многих лет до выхода на пенсию он преподавал в Улан-Удэнском музыкальном колледже. Известные в республике и за ее пределами композиторы – Юрий Ирдынеев, Виктор Усович, Лариса Санжиева, Екатерина Олерская – ученики Сергея Манжигеева по классу композиции.
Музыка Манжигеева широко известна и популярна. Симфоническая увертюра «Дружба», «Сюита на народные темы», «Памяти героев», «Два бурятских танца» привлекали слушателей красочной образностью, теплотой высказывания, яркостью оркестрового письма композитора. Хореографические постановки «Наездники», «Цветок Байкала», «Тетерева», «Буряад амаршалгын хатар», «Баторы» на оригинальную и неповторимую музыку Манжигеева много раз звучали на лучших сценических площадках нашей страны и за рубежом, и зрители через музыку и танец получали представление о самобытной и красочной культуре Бурятии.
Особую популярность принесли ему песни - более 100 сочинений, среди которых «Шамхандаа», «Дэлхэй минии альган дээрэ», «Эжымни», сообщает пресс-служба министерства культуры Бурятии.